空氣中的菌種與動植物接觸，產生醱酵作用的過程。傳統製造香腸、醋或釀酒者採用這種方式，容易使不良的菌種帶入食物中，後來改用人工的方式，把良好的菌種培養在隔離的環境中，避免不良菌種滲入，即所謂的「菌䴚」。目前發展出來的菌䴚種類包括乳酸桿菌屬、細球菌屬及非病原性葡萄球菌屬等。